Iniciar códon - Start codon
O códon de início é o primeiro códon de um transcrito de RNA mensageiro (mRNA) traduzido por um ribossomo . O códon inicial sempre codifica para metionina em eucariotos e Archaea e uma N-formilmetionina (fMet) em bactérias, mitocôndrias e plastídeos . O códon de início mais comum é AUG (ou seja, ATG na sequência de DNA correspondente).
O códon de início é freqüentemente precedido por uma região 3 'não traduzida ( 3' UTR ). Em procariotos, isso inclui o local de ligação ao ribossomo .
Códons de início alternativos
Os códons de início alternativos são diferentes do códon AUG padrão e são encontrados tanto em procariotos (bactérias e arquéias) quanto em eucariotos . Os códons de início alternativo ainda são traduzidos como Met quando estão no início de uma proteína (mesmo se o códon codificar um aminoácido diferente). Isso ocorre porque um RNA de transferência separado (tRNA) é usado para a iniciação.
Eucariotos
Códons de início alternativo (não-AUG) são muito raros em genomas eucarióticos. No entanto, códons de início não AUG de ocorrência natural foram relatados para alguns mRNAs celulares. Sete das nove possíveis substituições de nucleotídeo único no códon de início de AUG da di-hidrofolato redutase eram funcionais como locais de início da tradução em células de mamíferos. Além da via canônica do códon Met-tRNA Met e AUG, as células de mamíferos podem iniciar a tradução com leucina usando um leucil-tRNA específico que decodifica o códon CUG.
Candida albicans usa um códon de início CAG.
Procariontes
Os procariotos usam códons de início alternativo significativamente, principalmente GUG e UUG. Esses códons de início alternativo e a frequência de seu uso em comparação com os eucariotos foram estudados e demonstraram refutar a teoria do ancestral comum.
E. coli usa 83% AUG (3542/4284), 14% (612) GUG, 3% (103) UUG e um ou dois outros (por exemplo, um AUU e possivelmente um CUG).
As regiões de codificação bem conhecidas que não têm códons de iniciação AUG são aquelas de lacI (GUG) e lacA (UUG) no operon lac de E. coli . Dois estudos mais recentes mostraram independentemente que 17 ou mais códons de início não AUG podem iniciar a tradução em E. coli .
Mitocôndria
Os genomas mitocondriais usam códons de início alternativo de forma mais significativa (AUA e AUU em humanos). Muitos desses exemplos, com códons, intervalo sistemático e citações, são fornecidos na lista de tabelas de tradução do NCBI .
Código genético padrão
Propriedades bioquímicas de aminoácidos | Não polar | Polar | Básico | Ácido | Rescisão: códon de parada |
1ª base |
2ª base | 3ª base |
|||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
você | C | UMA | G | ||||||
você | UUU | (Phe / F) Fenilalanina | UCU | (Ser / S) Serina | UAU | (Tyr / Y) Tirosina | UGU | (Cys / C) Cisteína | você |
UUC | UCC | UAC | UGC | C | |||||
UUA | (Leu / L) Leucina | UCA | UAA | Parar ( ocre ) | UGA | Parar ( Opala ) | UMA | ||
UUG | UCG | UAG | Parar ( âmbar ) | UGG | (Trp / W) Triptofano | G | |||
C | CUU | CCU | (Pro / P) Proline | CAU | (His / H) Histidina | CGU | (Arg / R) Arginina | você | |
CUC | CCC | CAC | CGC | C | |||||
CUA | CCA | CAA | (Gln / Q) Glutamina | CGA | UMA | ||||
CUG | CCG | CAG | CGG | G | |||||
UMA | AUU | (Ile / I) Isoleucina | ACU | (Thr / T) Treonina | AAU | (Asn / N) Asparagina | AGU | (Ser / S) Serina | você |
AUC | ACC | AAC | AGC | C | |||||
AUA | ACA | AAA | (Lys / K) Lisina | AGA | (Arg / R) Arginina | UMA | |||
AGO | (Met / M) Metionina | ACG | AAG | AGG | G | ||||
G | GUU | (Val / V) Valina | GCU | (Ala / A) Alanina | GAU | (Asp / D) ácido aspártico | GGU | (Gly / G) Glicina | você |
GUC | GCC | GAC | GGC | C | |||||
GUA | GCA | GAA | (Glu / E) ácido glutâmico | GGA | UMA | ||||
GUG | GCG | MORDAÇA | GGG | G |
- A O códon AUG codifica a metionina e serve como um local de iniciação: o primeiro AUG naregião de codificação deummRNAé onde a tradução em proteína começa. Os outros códons iniciais listados pelo GenBank são raros em eucariotos e geralmente códigos para Met / fMet.
- B ^ ^ ^ A base histórica para designar os códons de parada como âmbar, ocre e opala é descrita em uma autobiografia de Sydney Brenner e em um artigo histórico de Bob Edgar.
Códons de início projetados
TRNAs iniciadores projetados (tRNA fMet2 com anticódon CUA) foram usados para iniciar a tradução no códon de parada âmbar UAG. Este tipo de tRNA projetado é chamado de tRNA supressor de nonsense porque suprime o sinal de parada da tradução que normalmente ocorre nos códons UAG. Um estudo mostrou que o tRNA do iniciador âmbar não inicia a tradução em nenhum grau mensurável de códons UAG genomicamente codificados, apenas repórteres transmitidos por plasmídeo com fortes locais Shine-Dalgarno a montante .
Veja também
- Dogma central da biologia molecular
- Codon
- RNA mensageiro
- Missense mRNA
- Códon de parada
- RNA de transferência
- Tradução
Referências
links externos
- Os códigos genéticos. Compilado por Andrzej (Anjay) Elzanowski e Jim Ostell, Centro Nacional de Informações sobre Biotecnologia (NCBI), Bethesda, Maryland, EUA [1]