N- Formilmetionina - N-Formylmethionine

N- Formilmetionina
(S) -N-Formilmetionina V.1.svg
Nomes
Nome IUPAC
Ácido ( S ) -2-formilamino-4-metilsulfanilbutanoico
Outros nomes
Ácido 2-formilamino-4-metilsulfanil-butírico; Formilmetionina; N- Formil (metil) homocisteína
Identificadores
Modelo 3D ( JSmol )
Abreviações fMet
Número EC
UNII
Propriedades
C 6 H 11 N O 3 S
Massa molar 177,22 g / mol
Página de dados suplementares
Índice de refração ( n ),
constante dielétrica r ), etc.

Dados termodinâmicos
Comportamento da fase
sólido-líquido-gás
UV , IR , NMR , MS
Exceto onde indicado de outra forma, os dados são fornecidos para materiais em seu estado padrão (a 25 ° C [77 ° F], 100 kPa).
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Referências da Infobox

A N- formilmetionina (fMet, HCO-Met, For-Met) é um derivado do aminoácido metionina em que um grupo formil foi adicionado ao grupo amino . É especificamente usado para o início da síntese de proteínas a partir de genes bacterianos e organelares e pode ser removido pós-tradução .

O fMet desempenha um papel crucial na síntese de proteínas de bactérias, mitocôndrias e cloroplastos . Não é usado na síntese de proteínas citosólicas de eucariotos , onde genes nucleares de eucariotos são traduzidos . Também não é usado por Archaea . No corpo humano, o fMet é reconhecido pelo sistema imunológico como um material estranho, ou como um sinal de alarme liberado por células danificadas, e estimula o corpo a lutar contra uma infecção potencial.

Função na síntese de proteínas

fMet é um resíduo inicial na síntese de proteínas em bactérias e, conseqüentemente, está localizado no N- terminal do polipeptídeo em crescimento . O fMet é entregue ao complexo ribossomo (30S) - mRNA por um tRNA especializado (tRNA fMet ) que possui um anticódon 3'-UAC-5 ' que é capaz de se ligar ao códon de início 5'-AUG-3' localizado no mRNA . fMet é assim codificado pelo mesmo codão da metionina; no entanto, AUG também é o códon de iniciação da tradução . Quando o códon é usado para iniciação, fMet é usado em vez de metionina, formando assim o primeiro aminoácido à medida que a cadeia peptídica é sintetizada. Quando o mesmo códon aparece posteriormente no mRNA, a metionina normal é usada. Muitos organismos usam variações desse mecanismo básico.

A adição do grupo formil à metionina é catalisada pela enzima metionil-tRNA formiltransferase . Esta modificação é feita após a metionina ter sido carregada no tRNA fMet pela aminoacil-tRNA sintetase .

A própria metionina pode ser carregada em tRNA fMet ou tRNA Met . No entanto, a transformilase irá catalisar a adição do grupo formil à metionina apenas se a metionina tiver sido carregada no tRNA fMet , não no tRNA Met .

O N- terminal fMet é removido da maioria das proteínas, tanto do hospedeiro quanto recombinante, por uma sequência de duas reações enzimáticas. Primeiro, o peptídeo deformilase deformila-o, convertendo o resíduo de volta a uma metionina normal. Em seguida, a metionina aminopeptidase (MAP) remove o resíduo da cadeia.

As mitocôndrias de células eucarióticas , incluindo as de humanos, e os cloroplastos de células vegetais também iniciam a síntese de proteínas com fMet. Dado que mitocôndrias e cloroplastos têm essa síntese protéica inicial com fMet em comum com bactérias, isso tem sido citado como evidência para a teoria endossimbiótica .

Relevância para imunologia

Como o fMet está presente em proteínas produzidas por bactérias, mas não naquelas produzidas por eucariotos (exceto em organelas derivadas de bactérias), o sistema imunológico pode usá-lo para ajudar a distinguir o eu do não próprio. As células polimorfonucleares podem se ligar a proteínas começando com fMet e usá-las para iniciar a atração de leucócitos sanguíneos circulantes e, então, estimular atividades microbicidas, como a fagocitose .

Uma vez que o fMet está presente em proteínas feitas por mitocôndrias e cloroplastos, teorias mais recentes não o vêem como uma molécula que o sistema imunológico pode usar para distinguir o eu do não próprio. Em vez disso, oligopeptídeos e proteínas contendo fMet parecem ser liberados pela mitocôndria de tecidos danificados, bem como por bactérias danificadas e, portanto, podem ser qualificados como um sinal de "alarme", conforme discutido no modelo de imunidade de perigo . O oligopeptídeo prototípico contendo fMet é N-Formilmetionina-leucil-fenilalanina (FMLP), que ativa leucócitos e outros tipos de células por ligação com o receptor de formil peptídeo 1 (FPR1) e receptor de formil peptídeo 2 (FPR2) acoplados à proteína G ( veja também receptor de formil peptídeo 3 ). Atuando por meio desses receptores, os oligopeptídeos e proteínas contendo fMet são parte do sistema imunológico inato ; eles funcionam para iniciar respostas de inflamação aguda, mas em outras condições funcionam para inibir e resolver essas respostas. Os oligopeptídeos e proteínas contendo fMet também funcionam em outras respostas fisiológicas e patológicas.

Veja também

Referências

links externos