Código de plastídio bacteriano, arqueado e vegetal - Bacterial, archaeal and plant plastid code

O código de plastídio bacteriano, arqueano e vegetal (tabela de tradução 11 ) é o código de DNA usado por bactérias , arquéias , vírus procarióticos e proteínas cloroplásticas . É essencialmente o mesmo que o código padrão , no entanto, existem algumas variações em códons de início alternativos .

O código

Propriedades bioquímicas de aminoácidos Não polar Polar Básico Ácido Rescisão: códon de parada
Código genético padrão
1ª
base 		2ª base 3ª
base
você C UMA G
você UUU (Phe / F) Fenilalanina UCU (Ser / S) Serina UAU (Tyr / Y) Tirosina UGU (Cys / C) Cisteína você
UUC UCC UAC UGC C
UUA (Leu / L) Leucina UCA UAA Parar ( ocre ) UGA Parar ( Opala ) UMA
UUG UCG UAG Parar ( âmbar ) UGG (Trp / W) Triptofano G
C CUU CCU (Pro / P) Proline CAU (His / H) Histidina CGU (Arg / R) Arginina você
CUC CCC CAC CGC C
CUA CCA CAA (Gln / Q) Glutamina CGA UMA
CUG CCG CAG CGG G
UMA AUU (Ile / I) Isoleucina ACU (Thr / T) Treonina AAU (Asn / N) Asparagina AGU (Ser / S) Serina você
AUC ACC AAC AGC C
AUA ACA AAA (Lys / K) Lisina AGA (Arg / R) Arginina UMA
AGO (Met / M) Metionina ACG AAG AGG G
G GUU (Val / V) Valina GCU (Ala / A) Alanina GAU (Asp / D) ácido aspártico GGU (Gly / G) Glicina você
GUC GCC GAC GGC C
GUA GCA GAA (Glu / E) ácido glutâmico GGA UMA
GUG GCG MORDAÇA GGG G
A O códon AUG codifica a metionina e serve como um local de iniciação: o primeiro AUG na região de codificação de um mRNA é onde a tradução em proteína começa. Os outros códons iniciais listados pelo GenBank são raros em eucariotos e geralmente códigos para Met / fMet.
B ^ ^ ^ A base histórica para designar os códons de parada como âmbar, ocre e opala é descrita em uma autobiografia de Sydney Brenner e em um artigo histórico de Bob Edgar.

Como no código padrão, a iniciação é mais eficiente no AUG. Além disso, os inícios de GUG e UUG são documentados em arquéias e bactérias. Em Escherichia coli , estima-se que o UUG atue como iniciador para cerca de 3% das proteínas da bactéria. CUG é conhecido por funcionar como um iniciador para uma proteína codificada por plasmídeo (RepA) em E. coli . Além das iniciações NUG, em casos raros, as bactérias podem iniciar a tradução de um códon AUU como, por exemplo, no caso da poli (A) polimerase PcnB e do gene InfC que codifica o fator de iniciação da tradução IF3 . As atribuições internas são as mesmas que no código padrão, embora UGA codifique em baixa eficiência para triptofano em Bacillus subtilis e, presumivelmente, em Escherichia coli .

Veja também

Referências

Este artigo incorpora texto da Biblioteca Nacional de Medicina dos Estados Unidos , que é de domínio público .