Asx turn - Asx turn
A curva Asx é uma característica estrutural em proteínas e polipeptídeos . Consiste em três resíduos de aminoácidos (marcados com i, i + 1 e i + 2) em que o resíduo i é um aspartato (Asp) ou asparagina (Asn) que forma uma ligação de hidrogênio de seu grupo de cadeia lateral CO para o grupo NH de cadeia principal de resíduo i + 2. Cerca de 14% dos resíduos Asx presentes nas proteínas pertencem às espiras Asx.
O nome "Asx" é usado aqui para representar os aminoácidos aspartato (Asp) ou asparagina (Asn).
Tipos
Quatro tipos de curvas Asx podem ser distinguidos: tipos I, I ', II e II'. Essas categorias correspondem às das voltas beta com ligações de hidrogênio mais conhecidas , que têm quatro resíduos e uma ligação de hidrogênio entre o CO do resíduo i e o NH do resíduo i + 3. As voltas Asx e as voltas beta têm laços ligados por hidrogênio estruturalmente semelhantes e exibem mimetismo da cadeia lateral-cadeia principal no sentido de que a cadeia lateral do resíduo i da volta Asx imita a cadeia principal do resíduo i da volta beta . Em relação à sua ocorrência em proteínas, eles diferem no fato de que o tipo I é o mais comum das quatro voltas beta, enquanto o tipo II 'é a mais comum das voltas Asx.
Ocorrência
As curvas Asx e ST ocorrem com frequência nos terminais N das hélices α . como parte de motivos Asx ou motivos ST, de modo que o Asx, serina ou treonina é o resíduo N. Eles são, portanto, frequentemente considerados como recursos de cobertura de hélice.
Motivos relacionados
Motivos semelhantes ocorrem com serina ou treonina como resíduo i, que são chamados de voltas ST . Apesar de serina e treonina terem um átomo de cadeia lateral a menos, de modo que o mimetismo da cadeia lateral-cadeia principal das voltas β é imperfeito, essas características ocorrem em proteínas como os quatro tipos em números que se aproximam das voltas Asx. Eles também exibem uma tendência de se substituir ao longo do tempo evolutivo.
Uma proporção de voltas Asx é acompanhada por uma ligação de hidrogênio mainchain – mainchain que os qualifica como motivos Asx .
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links externos
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