ASX motivo - Asx motif
O motivo Asx é uma característica que ocorrem vulgarmente em proteínas e polipéptidos . É constituída por quatro ou cinco amino ácidos resíduos com qualquer aspartato ou asparagina como o primeiro resíduo (resíduo i). Ela é definida por dois internos ligações de hidrogénio . Uma é entre o oxigénio de cadeia lateral de resuo i e a cadeia principal NH do resíduo i + 2 ou i + 3; o outro é entre o oxigio da cadeia principal do resuo i e a cadeia principal NH do resíduo i + i + 3 ou 4. Motivos Asx ocorrem vulgarmente em proteínas e polipéptidos.
Quando uma das ligações de hidrogénio é entre o oxigio da cadeia principal do resuo i e a cadeia lateral NH do resíduo i + 3, o motivo incorpora uma vez beta . Quando uma das ligações de hidrogénio é entre o oxigénio de cadeia lateral de resuo i e a cadeia principal NH do resíduo i + 2, o motivo incorpora uma vez Asx .
Tal como acontece com Asx transforma , uma proporção significativa de motivos Asx ocorrer no N-terminal de uma hélice alfa com o Asx como o tampão N resíduo. Motivos ASX, assim, muitas vezes descrito como características hélice nivelamento.
Um motivo relacionado é o motivo ST que tem serina ou treonina como o primeiro resíduo.
Referências
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