A controladora Volaris anunciou a criação da Volaris Costa Rica em março de 2016, momento em que a subsidiária já estava chegando ao fim da certificação com funcionários costarriquenhos. A Volaris confirmou em novembro de 2016 que sua subsidiária costarriquenha havia obtido seu certificado de operadora aérea . A Volaris Costa Rica operou seu primeiro voo - de sua base em San José para a Cidade da Guatemala - em 30 de novembro de 2016, usando um Airbus A320 alugado com tripulação da Volaris. A área de foco inicial da companhia aérea são os voos na América Central.