localização subcelular - Subcellular localization
As células de organismos eucarióticos são elaborada subdividido em compartimentos ligados à membrana funcionalmente distintos. Alguns dos principais constituintes de células eucarióticas são: espaço extracelular , citoplasma , núcleo , mitocôndria , aparelho de Golgi , retículo endoplasmático (ER), peroxissoma , vacúolos , citoesqueleto , nucleoplasma , nucléolo , matriz nuclear e ribossomas .
As bactérias também têm localizações subcelulares que podem ser separadas quando a célula é fraccionado. As localizações mais comuns referidos incluem o citoplasma , a membrana citoplasmática (também referida como a membrana interna em bactérias Gram-negativas bactérias), a parede celular (que é normalmente mais espesso em bactérias Gram-positivas bactérias) e o extracelular ambiente. O citoplasma, a membrana citoplasmática e da parede da célula são localizações subcelulares, ao passo que o ambiente extracelular não é claramente. A maioria das bactérias Gram-negativas contêm igualmente uma membrana exterior e o espaço periplasmático . Ao contrário de eucariotas, a maioria das bactérias não contêm organelos ligados à membrana, no entanto, existem algumas excepções (ou seja magnetossomos ).
Proteína subcelulares Localização Databases
As localizações subcelulares determinados experimentalmente de proteínas pode ser encontrado na UniProtKB , compartimentos , e em alguns recursos mais especializados, tais como a base de dados secretoma de bactérias de ácido láctico .
Existem também várias bases de dados de localização subcelulares com previsões computacionais , tais como o secretoma fúngica e base de conhecimento proteoma subcelular - versão 2 (FunSecKB2), o secretoma planta e subcelular base de conhecimento do proteoma (PlantSecKB), MetazSecKB para proteína localizações subcelulares de humanos e animais, e ProtSecKB para locais de proteína subcelular de todos os protistas.