NDPCP - NDPCP
5'-guanosil-metileno-trifosfato (GDPCP) e 5'-adenosil-metileno-trifosfato (ADPCP) são análogos da guanosina 5'-trifosfato (GTP) e adenosina 5'-trifosfato (ATP), que armazenam energia química do metabolismo na célula . A hidrólise de trifosfatos de nucleosídeo (NTPs), como ATP e GTP, produz energia, fosfato inorgânico (P i ou PP i ) e NDP ou NMP. O GDPCP e o ADPCP não estão sujeitos à hidrólise nas mesmas condições que os NTPs; é esta propriedade que os torna úteis em experimentos em bioquímica e biologia molecular .
Os NTPs podem ser hidrolisados nas ligações fosfodiéster entre os fosfatos , liberando energia e um ou mais dos três grupos fosfato. Além disso, os NTPs são componentes inextricáveis de algumas proteínas , onde seu papel pode ser estrutural e não precisa envolver a hidrólise. Em alguns casos, a presença de um NTP pode ser necessária para a associação de uma proteína com outra, enquanto a hidrólise é necessária para a dissociação. O GDPCP e o ADPCP poderiam ser usados em tal caso, uma vez que a associação ainda pode ocorrer, mas a dissociação dependente da hidrólise não.
O GDPCP foi usado para examinar o fator de alongamento procariótico EF-Tu . EF-Tu é necessário para a fase de alongamento da síntese de proteínas ( tradução ). EF-Tu requer GTP para que o ribossomo se ligue, necessário para recrutar um aminoacil-tRNA . A dissociação posterior de EF-Tu do ribossomo, no entanto, requer que o GTP primeiro seja hidrolisado em GDP e P i . O PIBCP foi usado no lugar do GTP para diferenciar entre essas duas etapas: o fator de alongamento poderia se associar, mas sem hidrólise, ele estava efetivamente preso.
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