Domínio de fibronectina tipo III - Fibronectin type III domain

Domínio de fibronectina tipo III
PDB 1ttg EBI.jpg
O décimo domínio tipo III da fibronectina
Identificadores
Símbolo fn3
Pfam PF00041
Clã Pfam CL0159
InterPro IPR003961
INTELIGENTE FN3
PRÓSITO PDOC00214
SCOP2 1ttf / SCOPe / SUPFAM
CDD cd00063
Membranome 66

O domínio da fibronectina tipo III é um domínio de proteína conservado evolucionário amplamente encontrado em proteínas animais. A proteína fibronectina na qual este domínio foi identificado pela primeira vez contém 16 cópias deste domínio. O domínio tem cerca de 100 aminoácidos de comprimento e possui uma estrutura de sanduíche beta . Dos três domínios do tipo fibronectina, o tipo III é o único sem a presença de ligações dissulfeto . Os domínios de fibronectina são encontrados em uma ampla variedade de proteínas extracelulares. Eles são amplamente distribuídos em espécies animais, mas também são encontrados esporadicamente em leveduras, proteínas vegetais e bacterianas.

Proteínas humanas contendo este domínio

ABI3BP ; ANKFN1 ; ASTN2 ; AXL ; BOC ; BZRAP1 ; C20orf75 ; CDON ; CHL1 ; CMYA5 ; CNTFR ; CNTN1 ; CNTN2 ; CNTN3 ; CNTN4 ; CNTN5 ; CNTN6 ; COL12A1 ; COL14A1 ; COL20A1 ; COL7A1 ; CRLF1 ; CRLF3 ; CSF2RB ; CSF3R ; DCC ; DSCAM ; DSCAML1 ; EBI3 ; EGFLAM ; EPHA1 ; EPHA10 ; EPHA2 ; EPHA3 ; EPHA4 ; EPHA5 ; EPHA6 ; EPHA7 ; EPHA8 ; EPHB1 ; EPHB2 ; EPHB3 ; EPHB4 ; EPHB6 ; EPOR ; FANK1 ; FLRT1 ; FLRT2 ; FLRT3 ; FN1 ; FNDC1 ; FNDC3A ; FNDC3B ; FNDC4 ; FNDC5 ; FNDC7 ; FNDC8 ; FSD1 ; FSD1L ; FSD2 ; GHR ; HCFC1 ; HCFC2 ; HUGO ; IFNGR2 ; IGF1R ; IGSF22 ; IGSF9 ; IGSF9B ; IL4R ; IL11RA ; IL12B ; IL12RB1 ; IL12RB2 ; IL20RB ; IL23R ; IL27RA ; IL31RA ; IL6R ; IL6ST ; IL7R ; INSR ; INSRR ; ITGB4 ; KAL1 ; KALRN ; L1CAM ; LEPR ; LIFR ; LRFN2 ; LRFN3 ; LRFN4 ; LRFN5 ; LRIT1 ; LRRN1 ; LRRN3 ; MERTK ; MID1 ; MID2 ; MPL ; MYBPC1 ; MYBPC2 ; MYBPC3 ; MYBPH ; MYBPHL ; MYLK ; MYOM1 ; MYOM2 ; MYOM3 ; NCAM1 ; NCAM2 ; NEO1 ; NFASC ; NOPE ; NPHS1 ; NRCAM ; OBSCN ; OBSL1 ; OSMR ; PHYHIP ; PHYHIPL ; PRLR ; PRODH2 ; PTPRB ; PTPRC ; PTPRD ; PTPRF ; PTPRG ; PTPRH ; PTPRJ ; PTPRK ; PTPRM ; PTPRO ; PTPRS ; PTPRT ; PTPRU ; PTPRZ1 ; PTPsigma ; PUNC ; RIMBP2 ; ROBO1 ; ROBO2 ; ROBO3 ; ROBO4 ; ROS1 ; SDK1 ; SDK2 ; SNED1 ; SORL1 ; SPEG ; TEK ; TIE1 ; TNC ; TNN ; TNR ; TNXB ; TRIM36 ; TRIM42 ; TRIM46 ; TRIM67 ; TRIM9 ; TTN ; TYRO3 ; UMODL1 ; USH2A ; VASN ; VWA1 ; dJ34F7.1 ; fmi ;

Veja também

  • Monocorpos são miméticos de anticorpos projetados (sintéticos) com base em um domínio de fibronectina tipo III (especificamente, o 10º domínio FN3 da fibronectina humana). Monocorpos apresentam loops diversificados ou fios diversificados de uma superfície plana de folha beta, que servem como epítopos de interação. Ligantes de monocorpo foram selecionados em uma ampla variedade de moléculas alvo e se expandiram além da faixa potencial de interfaces de ligação observada em anticorpos naturais e sintéticos.

Referências

  • Bazan JF (setembro de 1990). "Projeto estrutural e evolução molecular de uma superfamília de receptores de citocinas" . Anais da Academia Nacional de Ciências dos Estados Unidos da América . 87 (18): 6934–8. Bibcode : 1990PNAS ... 87.6934B . doi : 10.1073 / pnas.87.18.6934 . PMC  54656 . PMID  2169613 .
  • Little E, Bork P, Doolittle RF (dezembro de 1994). "Tracing the spread of fibronectin type III domains in bacterial glycohydrolases". Journal of Molecular Evolution . 39 (6): 631–43. Bibcode : 1994JMolE..39..631L . doi : 10.1007 / bf00160409 . PMID  7528812 . S2CID  11909704 .
  • Kornblihtt AR, Umezawa K., Vibe-Pedersen K, Baralle FE (julho de 1985). "Estrutura primária da fibronectina humana: splicing diferencial pode gerar pelo menos 10 polipeptídeos de um único gene" . The EMBO Journal . 4 (7): 1755–9. doi : 10.1002 / j.1460-2075.1985.tb03847.x . PMC  554414 . PMID  2992939 .