HDAC3 - HDAC3

HDAC3
Estruturas disponíveis
PDB	Pesquisa Ortholog: PDBe RCSB
Lista de códigos de id do PDB
	4A69
Identificadores
Apelido	HDAC3 , HD3, RPD3, RPD3-2, histona desacetilase 3
IDs externos	OMIM : 605166 MGI : 1343091 HomoloGene : 48250 GeneCards : HDAC3
Localização do gene ( humano )
Chr.	Cromossomo 5 (humano)
Fim	141.636.870 bp
Localização do gene ( mouse )
Chr.	Cromossomo 18 (mouse)
Fim	37.955.016 bp
Padrão de expressão de RNA
	Mais dados de expressão de referência
Ontologia do gene
Função molecular	• Atividade de histona desacetilase dependente de NAD (específico de H3-K14) ; • GO: 0001106 atividade corepressora de transcrição ; • atividade de histona desacetilase ; • atividade de proteína desacetilase ; • ligação de fator de transcrição ; • ligação de histona desacetilase ; • ligação de cromatina ; • ligação de NF-kappaB ; • GO: 0001948 ligação de proteína ; • ligação de enzima ; • atividade de hidrolase ; • ligação de ciclina;
Componente celular	• citoplasma ; • complexo histona desacetilase ; • citosol ; • Aparelho de Golgi ; • membrana plasmática ; • complexo repressor da transcrição ; • nucleoplasma ; • microtúbulo do fuso ; • núcleo ; • fuso mitótico;
Processo biológico	• desacetilação de histona H3 ; • regulação positiva da fosforilação de proteínas ; • regulação da transcrição, modelada por DNA ; • regulação da estabilidade da proteína ; • regulação negativa do processo apoptótico ; • regulação negativa da transcrição pela RNA polimerase II ; • resposta celular ao estresse de cisalhamento de fluido ; • transcrição, DNA- modelado ; • montagem do fuso ; • desacetilação de proteínas ; • regulação negativa da cascata JNK ; • ritmo circadiano ; • regulação negativa da diferenciação de miotubos ; • regulação negativa da transcrição, modelado por DNA ; • desacetilação de histona ; • regulação positiva da sinalização de TOR ; • regulação positiva da transcrição pela RNA polimerase II ; • regulação negativa da transcrição modelada por ácido nucléico ; • regulação do processo metabólico de lipídios ; • organização da cromatina ; • regulação positiva da importação de proteínas para o núcleo ; • desacetilação de histona H4 ; • regulação positiva da termogênese induzida pelo frio ; • regulação positiva da ubiquitinação de proteínas ; • regulação circadiana da expressão do gene sessão ; • regulação do ritmo circadiano ; • processo rítmico;
	Fontes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
	8841
	15183
	ENSG00000171720
	ENSMUSG00000024454
	O15379
	O88895
	NM_003883
	NM_010411
	NP_003874 ; NP_001341968 ; NP_001341969 ; NP_001341970
	n / D
	Wikidata
Ver / Editar Humano	Ver / Editar Mouse

A histona desacetilase 3 é uma enzima codificada pelo gene HDAC3 em humanos e camundongos.

Função

As histonas são proteínas altamente alcalinas que empacotam e ordenam o DNA em unidades estruturais chamadas nucleossomos, que constituem o principal componente proteico da cromatina. A acetilação e desacetilação da lisina mediada por enzima e pós-tradução das caudas das histonas altera a estrutura da cromatina local por meio da alteração da atração eletrostática entre a estrutura do DNA carregada negativamente e as histonas. HDAC3 é um membro de Classe I da superfamília das histona desacetilase (compreendendo quatro classes com base na função e homologia da sequência de DNA) que é recrutado para intensificadores para modular o epigenoma e a expressão do gene próximo. HDAC3 é encontrado exclusivamente no núcleo da célula onde é a única histona desacetilase endógena bioquimicamente purificada no complexo nuclear-receptor corepressor contendo NCOR e SMRT (NCOR2). Assim, HDAC3, ao contrário de outros HDACs, tem um papel único na modulação das atividades de transcrição dos receptores nucleares.

Funções alternativas

As histonas desacetilases podem ser reguladas por fatores endógenos, componentes da dieta, inibidores sintéticos e sinais derivados de bactérias. Estudos em camundongos com uma deleção específica de HDAC3 em células epiteliais intestinais (IECs) mostram uma expressão gênica de IEC desregulada. Nestes camundongos mutantes de deleção, perda de células de Paneth , função IEC prejudicada e alterações na composição intestinal de bactérias comensais foram observadas. Esses efeitos negativos não foram observados em camundongos livres de germes, indicando que os efeitos da deleção são vistos apenas na presença de colonização microbiana intestinal. Mas os efeitos negativos da deleção de HDAC3 não são devidos à presença de uma microbiota alterada porque camundongos normais livres de germes colonizados com a microbiota alterada não mostraram os efeitos negativos vistos em mutantes de deleção.

Embora o mecanismo preciso e os sinais específicos não sejam conhecidos, está claro que HDAC3 interage com sinais derivados de bactérias comensais da microbiota intestinal . Essas interações são responsáveis por calibrar as respostas das células epiteliais necessárias para estabelecer uma relação normal entre o hospedeiro e o comensal, bem como para manter a homeostase intestinal .

Organismos modelo

*Fenótipo de* camundongo nocaute *Hdac3*
Característica	Fenótipo
Viabilidade homozigota	Anormal
Estudo letal recessivo	Anormal
Fertilidade	Normal
Peso corporal	Normal
Ansiedade	Normal
Avaliação neurológica	Normal
Força de preensão	Normal
Prato quente	Normal
Dismorfologia	Normal
Calorimetria indireta	Normal
Teste de tolerância à glicose	Normal
Resposta auditiva do tronco cerebral	Normal
DEXA	Normal
Radiografia	Normal
Temperatura corporal	Normal
Morfologia do olho	Normal
Química Clínica	Normal
Imunoglobulinas plasmáticas	Normal
Hematologia	Normal
Linfócitos de sangue periférico	Normal
Teste de micronúcleo	Normal
Peso do coração	Normal
Histopatologia da pele	Normal
Histopatologia do cérebro	Normal
Infecção por Salmonella	Normal
Infecção por Citrobacter	Normal
Todos os testes e análises de

Organismos modelo têm sido usados no estudo da função HDAC3. Uma linha de mouse knockout condicional , chamada Hdac3 ^{tm1a (EUCOMM) Wtsi} foi gerada como parte do programa International Knockout Mouse Consortium , um projeto de mutagênese de alto rendimento para gerar e distribuir modelos animais de doenças para cientistas interessados.

Os animais machos e fêmeas foram submetidos a uma triagem fenotípica padronizada para determinar os efeitos da deleção.

Vinte e seis testes foram realizados em camundongos mutantes e duas anormalidades significativas foram observadas. Nenhum embrião mutante homozigoto foi identificado durante a gestação e, em um estudo separado, nenhum sobreviveu até o desmame . Os demais testes foram realizados em camundongos adultos mutantes heterozigotos ; nenhuma anormalidade significativa foi observada nestes animais.

Interações

HDAC3 demonstrou interagir com:

CBFA2T3 ,
CCND1 ,
GATA1 ,
GATA2 ,
GPS2 ,
GTF2I ,
HDAC4 ,
HDAC5 ,
HDAC7A ,
HDAC9 ,
MAP3K7IP2 ,
MAPK11 ,
NCOR1 ,
NCOR2 ,
PPARD ,
PPARG ,
PML
RBBP4 ,
RELA ,
RP ,
RUNX2 ,
SUV39H1 ,
TCP1 ,
TBL1X ,
TR2 ,
UBC ,
YY1 , e
ZBTB33 .

Veja também

Histona desacetilase

Referências

Leitura adicional

Verdin E, Dequiedt F, Kasler HG (2003). "Histona desacetilases Classe II: reguladores versáteis". Trends Genet . 19 (5): 286–93. doi : 10.1016 / S0168-9525 (03) 00073-8 . PMID 12711221 .

links externos

HDAC3 + proteína + humana na Biblioteca Nacional de Medicina dos Estados Unidos Medical Subject Headings (MeSH)

Este artigo incorpora texto da Biblioteca Nacional de Medicina dos Estados Unidos , que é de domínio público .

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