Família Crotonase - Crotonase family

A família da crotonase compreende proteínas mecanicamente diversas que compartilham uma estrutura quaternária trimérica conservada (às vezes um hexâmero que consiste em um dímero de trímeros), o núcleo do qual consiste em 4 voltas de uma superhélice (beta / beta / alfa) n.

Algumas enzimas na superfamília mostraram exibir atividades de desalogenase , hidratase e isomerase , enquanto outras foram implicadas na formação e clivagem de ligações carbono-carbono, bem como na hidrólise de tioésteres. No entanto, essas diferentes enzimas compartilham a necessidade de estabilizar um intermediário de ânion enolato derivado de um substrato de acil-CoA . Isso é realizado por dois grupos NH peptídicos estruturalmente conservados que fornecem ligações de hidrogênio às porções carbonila dos substratos acil-CoA e formam um "orifício de oxiânion". Os derivados de tioéster CoA se ligam em uma forma característica em forma de gancho e um túnel conservado liga o grupo panteína de CoA, que liga o local de ligação do ADP 3'-fosfato ao local da reação. As enzimas da superfamília da crotonase incluem:

• Enoil-CoA hidratase (crotonase; EC 4.2.1.17 ), que catalisa a hidratação de 2-trans-enoil-CoA em 3-hidroxiacil-CoA.
• 3-2trans-enoil-CoA isomerase (ou isomerase dodecenoil-CoA; EC 5.3.3.8 ), que muda a ligação dupla 3 dos intermediários da oxidação de ácidos graxos insaturados para a posição 2-trans.
• 3-hidroxbutiril-CoA desidratase (crotonase; EC 4.2.1.55 ), uma enzima bacteriana envolvida na via de produção de butirato / butanol.
• 4-Clorobenzoil-CoA desalogenase ( EC 3.8.1.6 ), uma enzima Pseudomonas que catalisa a conversão de 4-clorobenzoato-CoA em 4-hidroxibenzoato-CoA.
• Isomerase de dienoil-CoA , que catalisa a isomerização de 3-trans, 5-cis-dienoil-CoA em 2-trans, 4-trans-dienoil-CoA.
• Naftoato sintase (MenB, ou DHNA sintetase; EC 4.1.3.36 ), uma enzima bacteriana envolvida na biossíntese de menaquinona (vitamina K2).
• Carnitina racemase (gene caiD), que catalisa a conversão reversível de crotonobetaína em L-carnitina em Escherichia coli .
• Metilmalonil CoA descarboxilase (MMCD; EC 4.1.1.41 ), que possui uma estrutura hexamérica (dímero de trímeros).
• Carboximetilprolina sintase (CarB), que está envolvida na biossíntese de carbapenem.
• 6-oxo cânfora hidrolase , que catalisa a dessimetrização de beta-dicetonas bicíclicas em cetoácidos opticamente ativos.
• A subunidade alfa do complexo de oxidação de ácidos graxos , um complexo multienzimático que catalisa as três últimas reações do ciclo de beta-oxidação de ácidos graxos.
• Proteína AUH , um homólogo bifuncional de ligação ao RNA da enoil-CoA hidratase.

Proteínas humanas contendo este domínio

AUH ; CDY2B ; CDYL ; CDYL2 ; DCI ; ECH1 ; ECHDC1 ; ECHDC2 ; ECHDC3 ; ECHS1 ; EHHADH ; HADHA ; HCA64 ; HIBCH ; PECI ;

Referências