FLNA - FLNA
Filamina A, alfa ( FLNA ) é uma proteína que em humanos é codificada pelo gene FLNA .
Função
A proteína de ligação à actina, ou filamina , é uma proteína de 280 kD que reticula os filamentos de actina em redes ortogonais no citoplasma cortical e participa da ancoragem de proteínas de membrana para o citoesqueleto de actina . A remodelação do citoesqueleto é fundamental para a modulação da forma e migração celular. A filamina A, codificada pelo gene FLNA, é uma filamina amplamente expressa que regula a reorganização do citoesqueleto de actina ao interagir com integrinas , complexos de receptores transmembrana e mensageiros secundários .
Estrutura
A estrutura da proteína inclui um domínio N terminal de ligação à actina , 24 repetições internas e 2 regiões de dobradiça.
Interações
Foi demonstrado que o filamin interage com:
Edição de RNA
O resíduo editado foi previamente registrado como um polimorfismo de nucleotídeo único (SNP) em dbSNP .
Modelo
A edição de RNA de A a I é catalisada por uma família de adenosina desaminases que atuam em RNA (ADARs) que reconhecem especificamente as adenosinas nas regiões de fita dupla de pré-mRNAs e as desaminam em inosina. As inosinas são reconhecidas como guanosina pela maquinaria translacional das células. Existem três membros da família ADAR, ADARs 1-3, sendo o ADAR 1 e o ADAR 2 os únicos membros enzimaticamente ativos. Pensa-se que o ADAR3 tem um papel regulador no cérebro. ADAR1 e ADAR 2 são amplamente expressos em tecidos, enquanto ADAR 3 é restrito ao cérebro. As regiões de fita dupla do RNA são formadas por emparelhamento de bases entre resíduos em uma região complementar à região do local de edição. Esta região complementar é geralmente encontrada em um íntron vizinho, mas também pode estar localizada em uma sequência exônica. A região que forma pares de bases com a região de edição é conhecida como Editing Complentary Sequence (ECS).
Local
O único local de edição do pré-mRNA de FLNA está localizado dentro do aminoácido 2341 da proteína final. O códon da glutamina (Q) é alterado devido a uma desaminação específica do local de uma adenosina no local de edição para um códon da arginina (R). Prevê-se que a região de edição forme uma região de fita dupla de 32 pares de bases de comprimento com uma sequência complementar de cerca de 200 nucleotídeos a jusante do local de edição. Este ECS é encontrado em uma sequência intrônica. A edição no site Q / R provavelmente envolverá ADAR1 e ADAR2.Mice nocautes ADAR2 mostram uma diminuição na edição no site Q / R. Nocautes duplos ADAR1 não têm efeito na edição.
Estrutura
A adenosina editada está localizada na repetição do tipo imunogloulin 22 da proteína. Esta região é um domínio de ligação à integrina β e um domínio de ligação RAC1 . A mudança de aminoácidos provavelmente afetará o potencial eletrostático dos domínios de ligação. O local de edição de FLNA é 2 nucleotídeos de um local de splice como o local R / G de GluR-2. Ambas as transcrições têm 7/8 nucleotídeos idênticos em torno de seus locais de edição. Uma vez que é amplamente considerado que a edição no local GLUR-2 Q / R influencia o splicing, a sequência e a similaridade do local de edição podem significar que a edição no local FLNA também pode regular o splicing. Experimentos in vitro de gluR-2 mostraram que a presença de ADAR2 resulta na inibição do splicing. A análise dos dados de EST para FLNA mostra que há uma ligação entre a edição do códon do último exon e a retenção do intron seguinte.
Função
É provável que a mudança no potencial eletrostático efetue a ligação do FLNA às muitas proteínas com as quais ele interage.
Referências
Leitura adicional
- Light S, Sagit R, Ithychanda SS, Qin J, Elofsson A (setembro de 2012). "A evolução da filamina - uma perspectiva de repetição do domínio da proteína" . Journal of Structural Biology . 179 (3): 289–98. doi : 10.1016 / j.jsb.2012.02.010 . PMC 3728663 . PMID 22414427 .
- Stossel TP, Condeelis J, Cooley L, Hartwig JH, Noegel A, Schleicher M, Shapiro SS (2001). "Filaminas como integradores de mecânica celular e sinalização". Nat. Rev. Mol. Cell Biol . 2 (2): 138–45. doi : 10.1038 / 35052082 . PMID 11252955 . S2CID 5203942 .
- van der Flier A, Sonnenberg A (2001). “Aspectos estruturais e funcionais das filaminas” . Biochim. Biophys. Acta . 1538 (2–3): 99–117. doi : 10.1016 / S0167-4889 (01) 00072-6 . PMID 11336782 .